中药材所育种与资源团队在《Horticulture Research》上发表黄连“楚连1号”基因组组装相关论文

　　近日，育种与资源团队在园艺研究领域顶级期刊《Horticulture Research》（IF=8.7）在线发表了黄连基因组学与分子育种方面的重要研究成果“Chromosome-scale assembly of the elite Coptis chinensis cultivar 'Chulian No.1' and decoding of fine clonal variations using geospatial-genomic machine learning to facilitate medicinal plant breeding”。

　　黄连作为我国重要的传统中药材，其品种改良长期受限于基因组信息匮乏与遗传同质化严重等瓶颈问题。该研究完成了黄连优良栽培种“楚连1号”染色体级别的高质量基因组组装，并创新性地利用地理空间-基因组机器学习方法，成功解析了235份黄连种质资源的精细克隆变异，揭示了传统方法无法检测的生态地理群体结构。

　　研究首次将机器学习与群体基因组学相结合，突破了克隆繁殖药用植物遗传分析的难题，为“道地药材”形成机制提供了基因组学证据。同时，通过全基因组关联分析定位到调控叶片光泽与抗逆性的关键基因CcHAB1，阐明了该基因通过ABA信号通路调控蜡质合成、增强抗病性的分子机制，为黄连抗逆育种提供了重要靶点。该研究不仅为黄连分子育种提供了高质量的基因组资源，也为其他无性繁殖药用植物的精准育种提供了全新的研究范式，对推动中药材产业高质量发展具有重要意义。

　　我院中药材所为第一完成单位，余凯迪博士后和杨钰莹助理研究员为共同第一作者，通讯作者为中药材研究所郭杰研究员。本研究获湖北省种业高质量发展支撑项目（HBZY2023B00506）和湖北省自然科学基金（2025AFD152）等项目支持。

　　文献信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhag112